Но давайте проверим: попробуйте поприжимать, поразминать заднюю поверхность шеи и верхнюю часть спину (куда рука достанет). Если вы почувствуете боль в самих мышцах, которая затем уже отдаёт в голову, то, скорее всего, причина боли - в спазмировании этих мышц. Это часто бывает, если нервничать или долго сидеть у компьютера - мышцы спазмируются. Тогда:

1)Поделайте круговые движения головой и плечами (чтобы ослабить спазм).
2) Сделайте себе самомассаж (см. ссылку: http://богдан.net/publ/3-1-0-65 ).
3) ещё хорошо полежать затылком на каком-нибудь аппликаторе (аппликаторе Ляпко, например).

  А на будущее, пожалуйста, следите за этой областью: чтобы напряжения не накапливались, нужно регулярно их расслаблять, разминая  и протряхивая эту область.
Будьте здоровы!